Marais de Brière et de Guérande, Marais breton et de l’Erdre, estuaire de la Loire, vallée de la Loire, marais de Vilaine, lac de Grand-Lieu, marais de Goulaine, Basses Vallées angevines, marais du Jaunay, de Talmont, d’Olonne…

Les grandes zones humides reconnues au niveau national et international sont nombreuses en Pays de la Loire.

Dans le cadre du programme européen soutenu par le fonds européen FEADER, la Région apporte son soutien financier à la mise en oeuvre de mesures agro-environnementales dites de niveau 2, les plus exigeantes.

Sur certains sites (marais de Vilaine, partie indivise du marais de Brière), la Région intervient plus fortement encore, après concertation avec les acteurs concernés et au regard des enjeux écologiques.